Dr John Thomas adalah Ahli Bedah Saraf Terakreditasi Dewan Spesialis dengan 20 tahun pengalaman dalam bedah saraf.  

Dari tahun 1998, Dr Thomas bekerja sebagai konsultan bedah saraf di Singapore General Hospital (SGH), naik untuk melayani sebagai konsultan senior dan kepala Departemen Bedah Saraf. Di bawah kepemimpinannya, Departemen Bedah Saraf menerima ulasan yang luar biasa selama akreditasi rumah sakit internasional pertama SGH oleh Joint Commission International (JCI).  

Di NNI dan SGH, ia adalah konsultan utama untuk Layanan Bedah Saraf Fungsional, yang menangani Stimulasi Otak Mendalam untuk Penyakit Parkinson dan gangguan pergerakan, operasi epilepsi, dekompresi mikro-vaskular untuk neuralgia trigeminal, kejang hemifacial, dan simpatektomi endoskopi untuk hiperhidrosis (telapak tangan berkeringat) .

Dia juga menjadi konsultan utama untuk Layanan Radiosurgery untuk tumor otak jinak dan ganas, tumor tulang belakang, malformasi arterio-vena otak dan sumsum tulang belakang serta neuralgia trigeminal. Dr Thomas juga merupakan konsultan utama untuk neuro-onkologi untuk tumor otak, operasi dasar tengkorak untuk tumor otak yang kompleks dan operasi aneurisma.  

Sejak 1998, Dr Thomas telah terlibat dalam pengajaran mahasiswa kedokteran, dokter bedah saraf, dan konsultan junior. Dr Thomas adalah profesor rekanan tambahan di Duke-NUS Graduate Medical School. Dia adalah direktur program pendiri Program Residensi Sub-spesialisasi Bedah Singhealth. Minat penelitiannya adalah di bidang tumor otak (neuro-onkologi), radiosurgery dan bedah saraf fungsional.   Dr Thomas adalah konsultan tamu di National Neuroscience Institute (NNI), Singapore General Hospital, National Cancer Centre (NCC) dan Singapore National Eye Center (SNEC). Dr Thomas juga telah ditunjuk oleh Departemen Kesehatan (Singapura) sebagai Ketua Komite Akreditasi Kependudukan untuk Bedah Saraf di Singapura, yang mengawasi pelatihan bedah saraf untuk Singapura.  

Dr Thomas memulai pelatihan bedah saraf di Singapura pada 1995. Ia menerima HMDP Fellowship Kementerian Kesehatan (Singapura) ke Inggris dan menyelesaikan pelatihan bedah saraf lanjutan di Oxford, Inggris. Ia terlatih dalam Bedah otak dan tulang belakang, operasi tumor, operasi aneurisma dan stroke serta bedah saraf fungsional.